1．卫生在保障和改善民生、维护社会稳定、扩大内需中的作用研究；

2. 深入贯彻党的十七大精神，建立覆盖城乡居民的基本医疗卫生制度研究；

3．合理把握坚持公平效率统一、政府主导与发挥市场机制作用相结合的医改原则研究；

4. 各级政府卫生投入方式及其保障机制研究；

5. 医疗卫生改革监测、评估体系研究；

6. 探索建立医改的投入、过程、产出、结果、影响等环节监测评估指标研究；

7. 对第四次国家卫生服务调查的分析、评价与启示；

8. 卫生总费用研究；

9. 建立覆盖城乡居民的基本医疗保障体系研究；

10.城镇职工基本医疗保险、城镇居民基本医疗保险、新型农村合作医疗和城乡医疗救助等制度之间的协调和衔接的难点及实现形式研究；

11.探索基本医疗保险的支付制度改革研究；

12.参保及参合人员医保关系接续、异地就医及费用结算政策研究；

13.基本药物制度的定位与作用研究；

14.落实基本药物使用的财政补偿机制、指标采购和统一配送、价格核定、监督管理、医保目录、合理增补等实施难点及经验介绍；

15.基本药物制度激励机制的设计和构建研究；

16.基层医疗卫生服务网络体系（功能定位、基础设施、医卫队伍、适宜技术、适宜设备）建设研究；

17.基层医疗卫生服务机构实行收支两条线改革的难点及对策研究；

18.社区首诊、分级医疗和双向转诊制度研究；

19.不同级别不同类型医疗机构功能、职责及分工协作机制研究；

20.促进基本公共卫生服务均等化的途径、方式、实现形式研究；

21.加快落实六项重大公共卫生项目研究；

22.公共卫生服务范围、项目、内容及其成本研究；

23.公共卫生机构绩效评价制度研究；

24.公立医院改革试点的经验介绍与评析；

25.政事分开、管办分开的功力医院管理体制研究；

26.完善公立医院运行、补偿、监管机制研究；

27.提高公立医院的服务质量、管理水平和运行效率研究；

28.医疗卫生机构绩效工资改革的难点与对策研究；

29.反映市场供求和成本变化的医疗服务和药品价格形成机制研究；

30.会计核算与成本核算的并轨研究；

31.经济杠杆在控制医疗费用中的应用与实践；

32.网络技术条件下的会计内部控制制度研究；

33.财务预算的细化及执行机制研究；

34.公共卫生服务的内部成本控制机制研究；

35.新型农村合作医疗管理成本研究；

36.不同价款支付在医疗卫生机构的应用模式研究；

37.计算机及网络技术在卫生经济管理中的应用研究；

38.国外卫生经济介绍。